تعتبر الإدارة والعمليات من الإدارات الرئيسية بالصندوق حيث تتولى مسؤولية إدارة السياسات المالية خاصة والإدارية   عامة من خلال العمل على وضع اللوائح المالية والإدارية والعمل على تطبيقها بكفاءة   وفعالية مع استثمار الموارد المالية لتحقيق الأهداف الرئيسية للصندوق و لتحقيق تلك   الأهداف اضطلعت الإدارة والعمليات بعدة مهام ومسؤوليات كان لها الأثر المباشر في   إضفاء جو من الإنتاجية والفعالية على مستوى نشاط الصندوق بشكل عام وعلى الأقسام   والشعب التابعة للإدارة والعمليات بشكل خاص وتتلخص مهام ومسؤوليات الإدارة كالتالي :

-توفير المعلومات المالية اللازمة للإدارة العليا
-المحافظة على وضعية   سليمة للسيولة لمواجهة متطلبات الإقراض
-العمل على خفض التكاليف وزيادة   الإيرادات وذلك بتوجيه الموارد المالية للصندوق بالاتجاه الصحيح
-توفير احتياجات   الصندوق من المشتريات الرأسمالية والاستهلاكية والخدمية
-تقديم مختلف أنواع   الخدمات المساندة كالصيانة والاتصالات والمواصلات والخدمات العامة
وتتكون الإدارة والعمليات من   الشعبة المالية والشعبة الإدارية حيث يتضمنان الأقسام التالية:

- قسم   المحاسبة العامة
- قسم محاسبة القروض
- قسم الخدمات العامة
- قسم   المباني والصيانة
- قسم المشتريات والمستودعات
- قسم الترجمة